Exemple de recueil de données

Le plus grand obstacle à l`utilisation des référentiels et des collectes de données existants pour les études toxicogénomiques est peut-être la question du consentement éclairé et de ses implications éthiques, juridiques et sociales (voir le chapitre 11). Le but du programme était de fournir une base de données sur les SNP qui pourraient ensuite être utilisées dans les études épidémiologiques de plus grande envergure. Le réseau de recherche en pharmacogénétique parrainé par les NIH est un réseau de recherche collaboratif à l`échelle nationale qui vise à mieux comprendre comment la variation génétique chez les individus contribue aux différences dans les réponses aux médicaments. En conséquence, de nombreuses études manquent de la puissance statistique pour répondre à d`autres hypothèses. Évitez les moments difficiles, comme lors d`un changement de quart ou de pause déjeuner. Les analyses des modèles d`expression, cependant, sont considérablement affectées par ces derniers et une multitude d`autres variables qui sont essentielles pour une interprétation correcte des données. La base de données a ensuite été superposée avec des outils logiciels pour la classification rapide de nouveaux composés par des comparaisons avec les patrons d`expression des composés dans la base de données. Malgré les barrières importantes imposées par la confidentialité des patients et les questions de consentement éclairé, il existe des mécanismes pour assembler de grandes cohortes et collecter des échantillons qui peuvent être utilisés pour de multiples études et applications au profit de la santé publique. Le PDE a financé des projets de recherche extramurale dans plusieurs domaines, y compris la bioinformatique et les statistiques; Séquençage de l`ADN; analyse fonctionnelle; épidémiologie basée sur la population; questions éthiques, juridiques et sociales; développement technologique; et les modèles de souris de la maladie. Réputée MIAME/Tox, cette norme formerait la base de l`entrée de données normalisées dans les bases de données toxicogénomiques (MIAME 2003).

En 1999, un groupe représentant les principales bases de données sur les séquences d`ADN, les praticiens à grande échelle de l`analyse de microarray et un certain nombre d`entreprises développant du matériel, des réactifs et des outils logiciels de microarray ont commencé à discuter de ces questions. La création d`une base de données efficace nécessitera la collaboration étroite de diverses communautés toxicogénomiques (par exemple, les toxicologues et les scientifiques bioinformatiques) qui peuvent travailler ensemble pour créer des «cas d`utilisation» qui aident à préciser comment les données seront collectées et utilisée, qui dictera la structure de la base de données qui sera finalement créée. Inextricablement lié au projet du génome humain, le postulat sous-jacent de l`EGP était qu`un sous-ensemble de gènes existe qui ont une influence plus grande que la moyenne sur la susceptibilité humaine aux agents environnementaux. En résumé, l`état actuel des référentiels d`échantillons et leurs données associées sont moins qu`idéaux et il existe de nombreuses limitations et obstacles à leur utilisation immédiate dans le domaine émergent de la toxicogénomique. La distribution de données à accès limité est un autre enjeu majeur. Les essais cliniques et les études épidémiologiques n`ont généralement pas recueilli ou analysé des échantillons d`ADN (Forand et al. Si une taille de sous-groupe supérieure à un peut être choisie, la taille est généralement comprise entre trois et huit. La collecte, la conservation, l`annotation, le traitement et le stockage des échantillons biologiques (par exemple, le sang, l`ADN, l`urine, les écouvillons buccaux, les sections histologiques) et les données épidémiologiques pour de grandes études axées sur la population sont une entreprise coûteuse et à forte intensité de main-d`œuvre qui nécessite un investissement significatif dans la recherche future par les enquêteurs de l`étude initiale. Saeed et coll. Pour les données de variables: lors de la mesure des données de variables, une taille de sous-groupe supérieure à une est préférable car les tailles de sous-groupes plus larges donnent plus de possibilités d`analyse.

Le but de cette étape est d`indiquer le temps réel pour prendre les échantillons. Redican, S. Bien que chaque étude individuelle menée à l`aide d`approches toxicogénomiques puisse donner un aperçu des réponses particulières produites par des composés, la valeur réelle des données va au-delà des dosages individuels.